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随着生物信息学的发展,表型数据库作为生物科学研究的重要工具,日益受到重视,表型数据库汇集了大量的表型数据,为研究者提供了丰富的信息资源,本文将盘点全球范围内的表型数据库,以期为生物科学研究者提供有益的参考。
全球表型数据库盘点
1、Gene Expression Omnibus(GEO)
GEO是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)管理的基因表达数据库,汇集了全球范围内研究者提交的基因表达数据,GEO提供了丰富的数据类型,包括基因表达谱、蛋白质组学、代谢组学等,是研究基因表达调控的重要资源。
2、Gene Ontology(GO)
GO是一个描述基因功能的本体库,包括生物过程、细胞组分和分子功能三个层次,GO数据库提供了丰富的基因功能注释信息,有助于研究者理解基因的功能和调控机制。
3、Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)
KEGG是一个整合生物系统信息的数据库,包括基因组、酶、反应、通路、基因和疾病等信息,KEGG数据库为研究者提供了全面、系统的生物信息资源。
4、Reactome
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Reactome是一个整合生物化学反应和通路的数据库,旨在提供全面的生物化学反应和通路信息,Reactome数据库涵盖了生物体内所有的代谢途径和信号通路,是研究生物体内化学反应和通路的重要资源。
5、IntAct
IntAct是一个整合蛋白质相互作用数据的数据库,汇集了全球范围内研究者提交的蛋白质相互作用数据,IntAct数据库提供了丰富的蛋白质相互作用网络信息,有助于研究者理解蛋白质的功能和调控机制。
6、STRING
STRING是一个基于蛋白质序列相似性的蛋白质相互作用数据库,旨在预测蛋白质之间的相互作用关系,STRING数据库提供了丰富的蛋白质相互作用信息,有助于研究者揭示蛋白质之间的相互作用网络。
7、BioGPS
BioGPS是一个生物信息学资源导航平台,汇集了全球范围内的生物信息学数据库,BioGPS提供了丰富的数据库搜索、分析和可视化功能,为研究者提供了便捷的生物信息学资源。
8、PhenomeCentral
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PhenomeCentral是一个表型数据库,汇集了人类和动物表型数据,PhenomeCentral数据库提供了丰富的表型信息,有助于研究者了解基因与表型之间的关系。
9、Gene Expression Atlas
Gene Expression Atlas是由欧洲生物信息学研究所(EBI)管理的基因表达数据库,汇集了人类、小鼠和果蝇的基因表达数据,Gene Expression Atlas数据库为研究者提供了丰富的基因表达信息。
10、Agriphenome
Agriphenome是一个农业生物信息学数据库,汇集了农作物和家畜的表型数据,Agriphenome数据库为农业研究者提供了丰富的表型信息,有助于提高农作物和家畜的产量和品质。
全球表型数据库为生物科学研究提供了丰富的信息资源,有助于研究者深入了解基因、蛋白质和细胞等生物体的功能和调控机制,随着生物信息学的发展,表型数据库将继续为生物科学研究提供有力支持。
标签: #表型数据库有哪些
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